医院系统的洁净室最先用于手术室，也就是我们现在所说的净化工程手术室，开始它只是在矫形手术中获得广泛应用，因为矫形手术时间较长，易于引起感染，控制水平较理想的是使用手术台附近的空气洁净度达到100级，一般建议使用顶部高效空气过滤系统。
医院医疗行业是一个很庞大而特殊的行业特别是医院手术室对空气洁净度要求也很高，通常，合格的净化工程手术室或者医疗洁净室对医院空气的最低要求用效率为30%的预滤器和效率为90%的亚高效滤器结合使用进行过滤。一般情况下不需要高效过滤器过滤，但在特殊情况下如隔离室、特定的测试和护理区域则需要高效过滤器过滤。
净化工程手术室的等级标准有哪些？一级特别洁净手术室级别100；二级标准手术室级别1000和1万；三级一般洁净手术室级别10万;四级准洁净手术室和辅助用房级别30万；100级(特别洁净)瓣膜置换、心脏手术、器官移植、人工关节置换、神经外科、手术间；1000级（标准洁净）眼外科、整形外科、非全身烧伤、骨科、普外科的Ⅰ类手术、肝胆胰外科、体外循环灌注准备室；10000级（一般洁净室）胸外科、泌尿外科、妇产科、耳鼻咽喉科、普外科（除去Ⅰ类手术）手术间、无菌室；100000级别（一般洁净）门诊、急诊、感染手术、全身烧伤走廊、洗手间、麻醉预备室。
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